冷庫中自動化立體倉庫一般會有多個溫區，理貨區的溫度一般控制在0～+7℃，除此之外，還會涉及緩沖間，也可能會涉及到獨立除濕間等溫區的劃分，而庫區溫度一般會在0~-40℃之間。工人長期在冷庫中工作對身體會造成一定的傷害，自動化立體倉庫則只需要操作人員在庫外操作，無需進入冷庫工作區。
冷庫中降溫同樣需要很大一部分資金，在有限的空間內盡量存儲更多的貨物，這樣才能夠有效的降低單貨品存儲的成本。自動化立體倉庫的存儲屬于密集存儲，可以大大的提高冷庫的空間利用率，減少資源浪費，節省運營成本。
除此之外，自動化立體倉庫在高溫庫、無塵庫、防爆庫、易碎品庫等特殊倉庫，因為倉庫環境苛刻、空間利用率要求較高，采用自動化立體倉庫具有更大優勢。
